Kampene det gjelder er mesterligaoppgjøret mellom Valencia og Liverpool 17. september og UEFA-cupkampen mellom Hajduk Split og Fulham 19. september.
Fulham har levert inn en offisiell klage, og UEFA vil også basere etterforskningen på oppslag i mediene.
Sakene vil behandles av UEFAs kontroll- og disiplinærkomitè 10. oktober, melder forbundet i en pressemelding.
John Carew spilte en god kamp for Valencia da Liverpool ble slått 2-0.