Flyet sto tirsdag kveld på en militær flyplass i Wiltshire, klart til å ta av, men ble stanset i siste liten, etter at Den europeiske menneskerettsdomstolen ECHR stanset deportasjonen av flere av de sju asylsøkerne som var om bord.
Kilder i det britiske innenriksdepartementet bekrefter til både Sky News og BBC at det er domstolens inngripen som har stanset flygingen.
ECHR skriver i en kjennelse at minst en av asylsøkerne, en irakisk mann, må få bli i Storbritannia, da han kan være i fare om han blir sendt til Rwanda. Storbritannia er signatarstat til domstolen, som er separat fra EU.
Opprinnelig skulle 130 asylsøkere sendes ut med det første flyet. Men antallet ble til slutt redusert til sju, før tirsdagens domstolsbeslutning.
I en uttalelse sier hun at planen vil bidra til å ødelegge menneskesmuglernes forretningsmodell og forhindre tap av liv, samtidig som den sikrer at folk som virkelig trenger det, får beskyttelse.
– Det er veldig overraskende at Den europeiske menneskerettsdomstolen har grepet inn til tross for tidligere suksess i våre innenlandske domstoler, sier Patel.
– Vi vil ikke la oss avskrekke fra å gjøre det rette og gjennomføre planene for å kontrollere vårt lands grenser. Våre jurister ser over alle avgjørelser som er tatt i forbindelse med denne flygingen, og forberedelsene på den neste flygingen begynner nå, heter det videre
Mer enn 10.000 har krysset kanalen siden nyåret.
Avtalen med Rwanda om å sende asylsøkere dit ble inngått i april, med mål om å skremme migranter og flyktninger fra å krysse kanalen. I bytte får Rwanda flere millioner pund i utviklingsbistand.
Den er blitt kraftig kritisert av menneskerettsgrupper og FN. Kritikere sier at det er ulovlig og inhumant å sende folk til et land langt borte som de ikke ønsker å bo i.
I tillegg viser de til menneskerettighetssituasjonen i Rwanda, der president Paul Kagame har styrt med jernhånd i nærmere tre tiår.
Human Rights Watch har også dokumentert omfattende brudd på menneskerettighetene og anklager sikkerhetsstyrkene for å fengsle folk vilkårlig og torturere dem systematisk og på det groveste.
Regjeringen i Rwanda avviser kritikken.
ECHR sa tirsdag at deporteringene bør vente til de britiske domstolene tar en endelig avgjørelse om hvorvidt praksisen er lovlig. Det vil skje i juli.
Praksisen er ikke unik til Storbritannia. Politikere i Danmark og Østerrike vurderer lignende planer, mens Australia har driftet et asylmottak i Stillehavsnasjonen Nauru siden 2012.
