Saken etterforskes nå av den uavhengige spesialenheten for politisaker, opplyser Scotland Yard i en uttalelse fredag kveld.
Levende bilder av pågripelsen som er spredt på sosiale medier, viser to politibetjenter som med makt holder nede en mann som ligger på bakken iført håndjern.
En av betjentene ser ut til å presse kneet sitt mot mannens ansikt. Tilsynelatende roper mannen gjentatte ganger at de skal ligge unna halsen hans.
Forbipasserende grep inn under hendelsen i Islington sentralt i London torsdag og ba politiet slippe mannen.
Scotland Yard beskriver videoen som «ekstremt foruroligende» og påpeker at noen av pågripelsesmetodene som ble brukt, ikke inngår i politiets opplæring
London-ordfører Sadiq Khan kaller hendelsen for dypt bekymringsfull og forventer en rask og grundig etterforskning.